Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms