Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scg2Q03517 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms