Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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