Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms