Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms