Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a2Q02788 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a2Q02788 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms