Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms