Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms