Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd1Q01822 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms