Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms