Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja5Q01231 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja5Q01231 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms