Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms