Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx2Q00262 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms