Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms