Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
rp9P97762 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
rp9P97762 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
rp9P97762 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
rp9P97762 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
rp9P97762 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
rp9P97762 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
rp9P97762 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
rp9P97762 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
rp9P97762 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
rp9P97762 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms