Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bop1P97452 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bop1P97452 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms