Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpcaP84075 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpcaP84075 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpcaP84075 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms