Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ElocP83940 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElocP83940 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ElocP83940 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElocP83940 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ElocP83940 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms