Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx1P83917 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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