Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms