Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nucb2P81117 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nucb2P81117 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms