Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx3P81067 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms