Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx2P81066 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms