Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms