Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tbx1P70323 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tbx1P70323 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms