Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cux2P70298 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux2P70298 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux2P70298 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Cux2P70298 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux2P70298 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux2P70298 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms