Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf6P70279 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf6P70279 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms