Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NficP70255 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NficP70255 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NficP70255 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NficP70255 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NficP70255 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms