Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxd13P70217 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd13P70217 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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