Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf6P70196 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms