Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SbdsP70122 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SbdsP70122 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms