Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms