Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab1AP62821 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms