Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms