Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms