Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lmo4P61969 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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