Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc5P61460 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms