Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abce1P61222 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms