Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2iP60898 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms