Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nphp4P59240 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms