Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Samsn1P57725 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms