Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bace1P56818 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms