Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms