Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms