Protein–RNA interactions for Protein: P55012

Slc12a2, Solute carrier family 12 member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a2P55012 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a2P55012 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a2P55012 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms