Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms