Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CnbpP53996 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CnbpP53996 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CnbpP53996 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms