Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms