Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox5P52651 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms