Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApodP51910 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms